Haberler | UMass Amherst, Canlı Hücrelerde RNA’yı Gerçek Zamanlı Görüntülemek İçin Üç Renkli Floresan Görüntüleme Geliştirdi
University of Massachusetts Amherst’teki (UMass Amherst) kimyagerler, canlı memeli hücrelerinde birden fazla haberci RNA’yı (mRNA) gerçek zamanlı olarak eş zamanlı izleyen yeni bir üç renkli floresan görüntüleme yöntemi geliştirdi. Teknik, farklı RNA türlerini farklı floresan renklerle işaretleyerek araştırmacıların hücrelerin içindeki dinamik davranışlarını gözlemlemesine olanak tanıyor. Yaşamın temel moleküllerinden biri olan RNA’yı anlamak için önemli bir araç sunuyor. Bulgular yakın zamanda Nature Methods’da yayımlandı.
RNA, yaşamda temel ancak henüz tam olarak anlaşılamamış bir rol oynar. DNA ile proteinler arasında yalnızca bilgi taşımak ve hücreleri protein üretmeye yönlendirmekle kalmaz; genlerin açılıp açılmayacağını da düzenler, hücresel yapıların düzenlenmesine ve şekillenmesine yardımcı olur. Anormal RNA işlevi birçok hastalıkla yakından ilişkilidir; bu nedenle yaşam bilimlerinde RNA’yı doğal durumunu bozmadan incelemek büyük bir zorluktur.
Çalışmanın sorumlu yazarı, UMass Amherst’te kimya yardımcı doçenti Jiahui ‘Chris’ Wu, “RNA’nın birçok işlevini merak ediyoruz,” dedi. “Asıl soru, bunları nasıl inceleyeceğimiz. İdeal yaklaşım, RNA moleküllerini canlı hücrelerde doğrudan gözlemlemek; ancak RNA molekülleri çok küçük.”
Floresan mikroskopide bilim insanları, RNA’nın karmaşık hücresel arka plandan ayrışması için genellikle hedef RNA’ya floresan işaretleyiciler ekler. Yaygın kullanılan tekniklerden biri, görüntüleme amacıyla floresan bir proteini belirli bir RNA ile birleştiren ‘RNA saç tokası yöntemi’dir. Ancak floresan sinyal çoğu zaman sürekli aktif olduğundan arka plan gürültüsü oluşur ve görüntüleme doğruluğu azalır.
UMass Amherst ekibi bu teknikte önemli bir geliştirme yaptı. Kimya lisansüstü öğrencisi ve çalışmanın ilk yazarı Daisy Pham, ekibin yalnızca bir RNA molekülündeki belirli bir yapıya bağlandıktan sonra ışık veren yeni floresan proteinler tasarladığını ve böylece arka plan parazitini önemli ölçüde azalttığını açıkladı. Daha da önemlisi, araştırmacılar yeşil, kırmızı ve uzak-kırmızı ışık yayan, birbirinden bağımsız çalışabilen üç floresan protein tasarladı; bu sayede farklı işlevlere sahip RNA’lar aynı anda işaretlenip ayırt edilebiliyor.
Pham, “Artık farklı RNA türlerinin canlı hücrelerde aynı anda nasıl çalıştığını gözlemleyebiliyoruz,” dedi. “Bu, her birinin işlevini tam olarak nasıl yerine getirdiğini anlamaya bizi yaklaştırıyor.”
Ekip, görüntüleme yönteminin araştırma topluluğunun kullanımına sunulduğunu ve RNA işlevini incelemek için önemli yeni bir araca dönüşebileceğini vurguladı. Yöntem, RNA’nın kendisini önemli ölçüde bozmadan bilim insanlarının hücrelerin içinden daha doğru ve dinamik bilgiler elde etmesini sağlıyor. Bu gelişme, RNA görüntülemenin olanaklarını genişletiyor ve yaşam mekanizmaları ile RNA ile ilişkili hastalıkların anlaşılması için metodolojik bir temel sunuyor.
Çalışma, ABD Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH) ve UMass Amherst Uygulamalı Yaşam Bilimleri Enstitüsü (IALS) tarafından finanse edildi. IALS, temel araştırmaları insan sağlığını ve refahını iyileştiren yenilikçi uygulamalara dönüştürmek üzere 29 üniversite bölümündeki disiplinler arası uzmanlığı bir araya getiriyor.
Haberler | UMass Amherst, Canlı Hücrelerde RNA’yı Gerçek Zamanlı Görüntülemek İçin Üç Renkli Floresan Görüntüleme Geliştirdi
Haberler | UMass Amherst, Canlı Hücrelerde RNA’yı Gerçek Zamanlı Görüntülemek İçin Üç Renkli Floresan Görüntüleme Geliştirdi
University of Massachusetts Amherst’teki (UMass Amherst) kimyagerler, canlı memeli hücrelerinde birden fazla haberci RNA’yı (mRNA) gerçek zamanlı olarak eş zamanlı izleyen yeni bir üç renkli floresan görüntüleme yöntemi geliştirdi. Teknik, farklı RNA türlerini farklı floresan renklerle işaretleyerek araştırmacıların hücrelerin içindeki dinamik davranışlarını gözlemlemesine olanak tanıyor. Yaşamın temel moleküllerinden biri olan RNA’yı anlamak için önemli bir araç sunuyor. Bulgular yakın zamanda Nature Methods’da yayımlandı.
RNA, yaşamda temel ancak henüz tam olarak anlaşılamamış bir rol oynar. DNA ile proteinler arasında yalnızca bilgi taşımak ve hücreleri protein üretmeye yönlendirmekle kalmaz; genlerin açılıp açılmayacağını da düzenler, hücresel yapıların düzenlenmesine ve şekillenmesine yardımcı olur. Anormal RNA işlevi birçok hastalıkla yakından ilişkilidir; bu nedenle yaşam bilimlerinde RNA’yı doğal durumunu bozmadan incelemek büyük bir zorluktur.
Çalışmanın sorumlu yazarı, UMass Amherst’te kimya yardımcı doçenti Jiahui ‘Chris’ Wu, “RNA’nın birçok işlevini merak ediyoruz,” dedi. “Asıl soru, bunları nasıl inceleyeceğimiz. İdeal yaklaşım, RNA moleküllerini canlı hücrelerde doğrudan gözlemlemek; ancak RNA molekülleri çok küçük.”
Floresan mikroskopide bilim insanları, RNA’nın karmaşık hücresel arka plandan ayrışması için genellikle hedef RNA’ya floresan işaretleyiciler ekler. Yaygın kullanılan tekniklerden biri, görüntüleme amacıyla floresan bir proteini belirli bir RNA ile birleştiren ‘RNA saç tokası yöntemi’dir. Ancak floresan sinyal çoğu zaman sürekli aktif olduğundan arka plan gürültüsü oluşur ve görüntüleme doğruluğu azalır.
UMass Amherst ekibi bu teknikte önemli bir geliştirme yaptı. Kimya lisansüstü öğrencisi ve çalışmanın ilk yazarı Daisy Pham, ekibin yalnızca bir RNA molekülündeki belirli bir yapıya bağlandıktan sonra ışık veren yeni floresan proteinler tasarladığını ve böylece arka plan parazitini önemli ölçüde azalttığını açıkladı. Daha da önemlisi, araştırmacılar yeşil, kırmızı ve uzak-kırmızı ışık yayan, birbirinden bağımsız çalışabilen üç floresan protein tasarladı; bu sayede farklı işlevlere sahip RNA’lar aynı anda işaretlenip ayırt edilebiliyor.
Pham, “Artık farklı RNA türlerinin canlı hücrelerde aynı anda nasıl çalıştığını gözlemleyebiliyoruz,” dedi. “Bu, her birinin işlevini tam olarak nasıl yerine getirdiğini anlamaya bizi yaklaştırıyor.”
Ekip, görüntüleme yönteminin araştırma topluluğunun kullanımına sunulduğunu ve RNA işlevini incelemek için önemli yeni bir araca dönüşebileceğini vurguladı. Yöntem, RNA’nın kendisini önemli ölçüde bozmadan bilim insanlarının hücrelerin içinden daha doğru ve dinamik bilgiler elde etmesini sağlıyor. Bu gelişme, RNA görüntülemenin olanaklarını genişletiyor ve yaşam mekanizmaları ile RNA ile ilişkili hastalıkların anlaşılması için metodolojik bir temel sunuyor.
Çalışma, ABD Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH) ve UMass Amherst Uygulamalı Yaşam Bilimleri Enstitüsü (IALS) tarafından finanse edildi. IALS, temel araştırmaları insan sağlığını ve refahını iyileştiren yenilikçi uygulamalara dönüştürmek üzere 29 üniversite bölümündeki disiplinler arası uzmanlığı bir araya getiriyor.
Haber kaynağı:
İnternetten derlenmiştir